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技术与服务

CRISPR-dCas9转录激活

CRISPR/Cas9系统是一种由RNA引导Cas9蛋白对靶基因进行修饰的技术。将Cas9中切割域突变,就会使Cas9蛋白失去对DNA的切割活性,但不影响其与DNA的结合能力,这种失去DNA切割活性的Cas9蛋白被命名为 Dead Cas9(dCas9) 。利用gRNA介导dCas9能够精确识别靶基因的特点,将dCas9蛋白与具有转录激活功能的蛋白结构域融合,可构建具有转录激活活性的系统,简称CRISPRa。

与传统转基因相比,CRISPRa系统是通过激活细胞内源基因表达来提高目标基因的表达量,它不需要转入外源DNA,降低了由于转基因造成的基因组不可逆转突变的风险。另外结合gRNA文库,可同时激活多个基因的转录与表达。此前Gain-Of-Function筛选主要是通过cDNA文库实现,但由于部分cDNA克隆难度较大致使cDNA文库覆盖率不完全;同时cDNA文库并不能涵盖每个基因的所有转录本;基因的表达也会受到细胞内部元件的调控。利用dCas9-VP64-gRNA系统进行的高通量筛选可在同一个启动子上设计多个gRNA来提高基因的转录活性,基因转录本也会更为全面。已有研究表明,利用CRISPR/Cas9系统选择性的上调基因表达,可以用来诱导干细胞的分化或重编程、刺激组织再生、补偿遗传缺陷、激活已经失活的抑癌基因、进行基因功能筛选以及合成基因回路。

技术原理

CRISPR/Cas9系统转录激活原理:dCas9与转录活化域VP64/VPR融合,表达的融合蛋白在gRNA介导下结合到启动子区,并通过VP64/VPR激活区域与PolII结合,激活基因的转录。

服务流程

枢密科技可实现单个或多个基因的转录激活,也可以通过gRNA文库,实现全基因组的转录激活调控,用于基因功能的研究及靶基因的筛选。


服务项目周期

方案一:Crispr/dSaCas9转录激活系统-AAV

编号 项目内容 操作方法 周期(周)
1 sasgRNA的设计与构建
AAV-U6-sasgRNA-CMV-SV40-NLS-
saCas9-NLS-Flag-WPRE
1
设计8条sasgRNA序列,位置ATG上游0-400bp
2 sasgRNA的筛选
在B16细胞上进行筛选,最终选出有
效序列2-4条
2
3 转录激活载体构建
AAV-CMV-NLS-dSaCas9-NLS-V64-
U6-sgRNA
3
注:sgRNA串联几个待定,需要等筛选结果
4 qPCR方法转录激活验证 质粒转染,收细胞,内参GAPDH 1
5 病毒包装 病毒包装,纯化,滴度检测 3
合计  注:周期为工作日 10
交付内容:一个病毒和两个筛选报告

价格可联系销售人员咨询,欢迎前来询价。


方案二:Crispr/dSaCas9转录激活系统-Lentivirus

编号 项目内容 操作方 周期(周)
1 sasgRNA的设计与构建 LV-U6-sasgRNA-CMV-SV40 NLS-saCas9-NLS-Flag-P2A-Puro-T2A-EGFP-WPRE 1
设计8条sasgRNA序列,位置ATG上游0-400bp
2 sasgRNA的筛选
在B16细胞上进行筛选,最终选出有
效序列2-4条
2
3 转录激活载体构建
LV-CMV-NLS-dSaCas9-NLS-VPR-
U6-sgRNA
3
注:sgRNA串联几个待定,需要等筛选结果
4 qPCR方法转录激活验证 质粒转染,收细胞,内参GAPDH 1
5 病毒包装 病毒包装,纯化,滴度检测 3
合计  注:周期为工作日 10
交付内容:一个病毒和两个筛选报告

价格可联系销售人员咨询,欢迎前来询价。


注意:方案一中AAV(腺相关病毒载体)的载量为4.7kb,因此质粒中转录激活结构域选择片段大小为150bp的VP64;方案二中LV(慢病毒载体)的载量为6kb,因此质粒中转录激活结构域选择片段大小为1569bp的VPR(VP64, p65, and Rta );但是相关文献显示VP64对蛋白过表达的效果不佳,因此可按照需求选择其中一种病毒载体进行后期实验操作。

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