功能基因：eNpHR3.0：NpHR是光驱动的氯离子泵，属于Halorhodopsin。常见的版本为NpHR3.0，其在NpHR的基础上添加了内质网顺向运输信号和高尔基体向细胞膜转运信号，改善了其在细胞膜上的表达状况，是最常用的光抑制工具。NpHR通常用570nm左右的黄光驱动，可以和hChR2(H134R)同时使用。

hChR2(H134R)：是ChR2最常见形式，h指代该基因的编码序列经过适用人密码子表的优化，H134R指第134位的组氨酸突变为精氨酸，这个突变抑制了ChR2对H+的结合，增加了Na+的通过能力，从而增加了分子整体的电导率，进而增加了光照下激发的内向电流。一般用470nm左右的蓝光激发。

荧光蛋白：EGFP：绿色荧光蛋白，激发波长488nm，发射波长507nm。

调控元件：DIO：Double-floxed inverse Orientation，是和Cre重组酶配合控制目的基因表达的元件。如果没有Cre重组酶的话目的基因不表达，在有Cre的情况下目的基因才能正常表达。

2A：2A序列是一个短肽序列，当核糖体翻译到它的时候会自动跳开，继续翻译下游的阅读框，从而使同一个阅读框翻译成两个独立的蛋白。常用的2A序列包括T2A和P2A。运用于非融合表达中。