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【新品速递】枢密奥密克戎(Omicron)突变假病毒助力疫苗开发

2021-12-17  阅读量:300

Omicron变异株

奥密克戎(英文名:Omicron)是2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的变种 。最早于2021年11月9日在南非首次检测到。11月26日,WHO将其定义为第五种“关切变异株”。Omicron含有大量突变,数量是德尔塔的两倍。其同时具有变异株Alpha(阿尔法)、Beta(贝塔)、Gamma(伽玛)和Delta(德尔塔)刺突蛋白的重要氨基酸突变位点,包括增强细胞受体亲和力和病毒复制能力的突变位点。新冠病毒数据库GISAID目前共享的信息显示,奥密克戎变异株的突变位点数量明显多于近2年流行的所有新冠病毒变异株,尤其在病毒刺突(Spike)蛋白突变较多。


Omicron对疫情的影响

研究表明奥密克戎变异株同时存在“K417N+E484A+N501Y”三重突变,对现有疫苗免疫逃逸的能力增强;还存在其他多个可能降低部分单克隆抗体中和活性的突变;突变的叠加可能降低部分抗体药物对奥密克戎变异株的保护效力。Omicron变异株的出现给全球疫情防控带来了巨大困难。特效药物开发、有效疫苗开发,新冠康复者体内病毒水平及时监测评估,是从根源上战胜疫情的关键手段。针对Omicron可能存在显著的免疫逃逸的情况,仍需更多研究来明确Omicron的传染性、致病性。

枢密科技飞速投入研发力量,成功开发奥密克戎(Omicron)突变假病毒,协助科研人员快速评价新冠疫苗和抗体药物对Omicron的保护效果。


开发假病毒的意义

新冠病毒是高致病性呼吸道病毒,感染性极强,尤其是Omicron突变位点之多,其在部分区域的迅速流行更引起了全球的密切关注。然而,活病毒的研究对实验室安全级别要求极高,需要达到P3以上。目前国内能满足条件的实验室只有40多家,完全不能满足常规科学研究。因此,需开发一种能够在较低安全级别实验室进行研究的活病毒替代品。

假病毒(Pseudovirus)是指目的病毒能够整合另外一种不同种类病毒的囊膜糖蛋白,从而形成的具有外源性病毒的囊膜,而基因组保持着目的病毒本身基因组特性的病毒,它可携带荧光素酶/荧光蛋白等报告基因,具有高效、稳定、安全,可长期稳定制备,应用范围广等特点。目前,慢病毒、逆转录病毒、水泡性口炎病毒、腺病毒等都已被开发为假病毒在体内实验中广泛使用。假病毒已广泛用于病毒感染机制研究、中和抗体及抗病毒药物筛选和评价、血清中和抗体检测以及疫苗效价评估、病毒检测的标准品等领域。基于 SARS-CoV-2 假病毒载体(Pseudovirus VSV/LV-S)已被用于研究 SARS-CoV-2入侵人体细胞的具体机制。

BrainVTA开发了Omicron假病毒,该假病毒可在生物安全2级(BSL-2)中进行实验操作。


中和抗体实验

在假病毒的中和试验中,中和抗体抑制病毒进入细胞与ACE2表达细胞(HEK293T-hACE2和BHK-hACE2)中荧光素酶或荧光(EGFP和mCherry)信号水平的降低相关。该方法简单、灵敏度和精度高,适用于高通量实验。此外,在测试过程中没有使用活病毒。因此,该方法可作为在快速反应中安全进行血清学研究的替代方法。



构建模拟SARS-COV-2感染细胞/动物的研究模型



产品及服务


1.现货产品--各株系现货假病毒

类别 产品编号 产品名称 基因 突变位点信息
新冠VSV假病毒 野生型 SARS-CoV-2-V03001 PV-SARS-CoV-2-S-VSV-△G-EGFP EGFP 无突变
野生型 SARS-CoV-2-V03002 PV-SARS-CoV-2-S-VSV-△G-mCherry mCherry 无突变
野生型 SARS-CoV-2-V03005 PV-SARS-CoV-2-S-VSV-△G-Luciferase Luciferase 无突变
英国株B.1.1.7 SARS-CoV-2-A-V03005 PV-SARS-CoV-2-S(GB-B.1.1.7)-VSV-△G-Luciferase Luciferase
Spike(N501Y
A570D,P681H,T716I,S982A,D1118H)
SARS-CoV-2-A-V03002 PV-SARS-CoV-2-S(GB-B.1.1.7)-VSV-G-mCherry mCherry
南非株B.1.351 SARS-CoV-2-B-V03005 PV-SARS-CoV-2-S(SA-B.1.351)-VSV-△G-Luciferase Luciferase Spike(D80A,D215G,K417N,A701V,N501Y,E484K)
SARS-CoV-2-B-V03002 PV-SARS-CoV-2-S(SA-B.1.351)-VSV-G-mCherry mCherry
巴西株P.1 SARS-CoV-2-G-V03002 PV-SARS-CoV-2-S(BZ-P.1)-VSV-G-mCherry mCherry
SARS-CoV-2-G-V03005 PV-SARS-CoV-2-S(BZ-P.1)-VSV-△G-Luciferase Luciferase Spike(L18F,T20N,P26S,D138Y,R190S,K417T,E484K,N501Y,D614G,H655Y,T1027I)
印度株B.1.617.2 SARS-CoV-2-D-V03005 PV-SARS-CoV-2-S(IN-B.1.617.2)-VSV-△G-Luciferase Luciferase Spike(T19R,L452R,T478K,P681R,D950N)
SARS-CoV-2-D-V03002 PV-SARS-CoV-2-S(IN-B.1.617.2)-VSV-G-mCherry mCherry
印度株B.1.617.1 SARS-CoV-2-K-V03005 PV-SARS-CoV-2-S(IN-B.1.617.1)-VSV-△G-Luciferase Luciferase Spike(T95I,G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, P681R, Q1071H)
SARS-CoV-2-K-V03002 PV-SARS-CoV-2-S(IN-B.1.617.1)-VSV-G-mCherry mCherry
Omicron株B.1.1.529 SARS-CoV-2-O-V03002 PV-SARS-CoV-2-S(B.1.1.529)-VSV-G-mCherry mCherry
SARS-CoV-2-O-V03005 PV-SARS-CoV-2-S(B.1.1.529)-VSV-△G-Luciferase Luciferase
Spike(A67V, Δ69-70, T95I, G142D/Δ143-145, Δ211/L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P,S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y,Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K,
L981F)
BA.2 SARS-CoV-2-BA.2-V03005 PV-SARS-CoV-2-S(BA.2 )-VSV-△G-Luciferase Luciferase
SARS-CoV-2-BA.2-V03001 PV-SARS-CoV-2-S(BA.2)-VSV-△G-EGFP EGFP
SARS-CoV-2-BA.2-V03002 PV-SARS-CoV-2-S(BA.2)-VSV-△G-mCherry mCherry
BA.4 SARS-CoV-2-BA.4-V03005 PV-SARS-CoV-2-S(BA.4 )-VSV-△G-Luciferase Luciferase
Fig.1 新冠VSV系统假病毒


类别 株系 产品编号 产品名称 基因 突变位点信息
新冠LV假病毒 野生型 SARS-CoV-2-LV-0046 PV-SARS-CoV-2-S-LV-CMV-mCherry-WPRE mCherry 无突变
野生型 SARS-CoV-2-LV-0052 PV-SARS-CoV-2-S-LV-CMV-EGFP-WPRE EGFP 无突变
野生型 SARS-CoV-2-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S-LV-CMV–Luciferase-WPRE Luciferase 无突变
英国株B.1.1.7 SARS-CoV-2-A-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(GB-B.1.1.7)-LV-CMV-Luciferase-WPRE Luciferase
Spike(N501Y
A570D,P681H,T716I,S982A,D1118H)
南非株B.1.351 SARS-CoV-2-B-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(SA-B.1.351)-LV-CMV-Luciferase-WPRE Luciferase Spike(D80A,D215G,K417N,A701V,N501Y,E484K)
巴西株P.1 SARS-CoV-2-G-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(BZ-P.1)-LV-CMV-Luciferase-WPRE Luciferase Spike(L18F,T20N,P26S,D138Y,R190S,K417T,E484K,N501Y,D614G,H655Y,T1027I)
印度株B.1.617.2 SARS-CoV-2-D-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(IN-B.1.617.2)-LV-CMV-Luciferase-WPRE Luciferase Spike(T19R,L452R,T478K,P681R,D950N)
印度株B.1.617.1 SARS-CoV-2-K-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(IN-B.1.617.1)-LV-CMV-Luciferase-WPRE Luciferase Spike(T95I,G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, P681R, Q1071H)
Omicron株B.1.1.529(BA.1) SARS-CoV-2-O-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(B.1.1.529)-LV-CMV-Luciferase-WPRE Luciferase
Spike(A67V, Δ69-70, T95I, G142D/Δ143-145, Δ211/L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P,S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y,Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K,
L981F)
BA.2 SARS-CoV-2-BA.2-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(BA.2)-LV-CMV-Luciferase-WPRE Luciferase
BA.4 SARS-CoV-2-BA.4-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(BA.4)-LV-CMV-Luciferase Luciferase
BA.5 SARS-CoV-2-BA.5-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(BA.5)-LV-CMV-Luciferase Luciferase
BQ.1.1 SARS-CoV-2-BQ.1.1-LV-0588 PV-SARS-CoV-2-S(BQ.1.1)-LV-CMV-Luciferase Luciferase
Fig.2 新冠LV系统假病毒



优势:

a.生物安全性高。假病毒不具备自我复制能力,为单次感染病毒,无生物安全威胁。

b.表达效率高。48~72 小时后即可观测。

c.宿主细胞广。


2.SARS-CoV2相关细胞系产品

概述:携带有hACE2蛋白的HEK293T和BHK细胞系可用于模拟体外假病毒的感染实验和中和抗体检测实验,同时可选择红绿荧光蛋白进行定性区分和定量分析。

类别 名称 名称 荧光颜色
细胞系 293T-LV-0581 HEK293T-ACE2-mCherry 红色
293T-LV-0539 HEK293T-ACE2-EGFP 绿色
293T-LV-0707 HEK293T-ACE2
BHK-LV-0581 BHK-ACE2-mCherry 红色
BHK-LV-0539 BHK-ACE2-EGFP 绿色
BHK-LV-0707 BHK-ACE2

Fig.3 ACE2细胞系


3.中和抗体检测服务

BrainVTA可为您的抗体或血清样品提供中和抗体检测服务。利用我们包装的假病毒,可模拟抗体阻断病毒进入细胞的生物过程,检测抗体或血清对假病毒是否具有中和活性,从而筛选出具有中和活性的抗体或血清。


4.假病毒定制生产

可定制SARS-CoV-2其他非列表产品的突变体假病毒,除此之外,流感病毒、PRRSV等其他病毒的假病毒包装也可承接定制。



参考文献

[1] Thomas T. SARS-CoV-2 receptor ACE2 expression in the human heart: cause of a post-pandemic wave of heart failure [J]. European Heart Journal.2020.9(1):45.
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