蛋白质质谱鉴定
服务简介
质谱是将待测物质转化为气态离子并将离子按质荷比(m/z)进行分离,检测各种离子谱峰的强度而实现分析的一种方法。蛋白质质谱鉴定基于鸟枪法(Shot-gun),将蛋白条带或蛋白溶液酶切成肽段混合物,经高效液相色谱分离得到若干较为简单的组分,进入高分辨率质谱仪中进行分析。检索软件根据二级质谱信息与相应的数据库比对,结合匹配度打分及错配过滤,可得到肽段的确切序列,进而拼接出各蛋白的完整序列,从而实现对蛋白的鉴定。液质联用,分离效果好、分析速度快。可分析的样本包括2DE PAGE中的蛋白胶点、免疫共沉淀(Co-IP)样品、1D-SDS PAGE分离的蛋白胶条、蛋白质溶液等。双向电泳斑点或纯化蛋白质等简单样本,通常选择串联质谱(MS/MS)鉴定分析;蛋白质溶液、SDS-PAGE条带等混合样本,通常选择液相-串联质谱(LC-MS/MS)鉴定分析。质谱仪包括:高分辨率质谱平台技术,包括Thermo Fisher的Q Exactive质谱仪,LTQ Orbitrap Velos质谱仪,以及AB SCIEX的6500 Q TRAP质谱仪。
技术特点
1、高效:液质联用,可一次性鉴定多达上千种蛋白质
2、灵敏:可检测样品浓度极低的胶点
3、通用:可分析蛋白胶条胶点、免疫共沉淀洗脱液等多种形式的样品
技术流程
蛋白胶条/混合液样本——蛋白酶解——液质联用分析——数据库检索——蛋白质鉴定结果
应用领域
1、亚细胞组分全谱分析
2、免疫共沉淀Co-IP后的互作蛋白鉴定
3、复杂蛋白质样本鉴定
样本要求
1、SDS-PAGE gels样品
(1)Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain样品均可,银染的样品无需脱色处理;
2、液体样品(In solution format)
(1)样品中蛋白量>10ug,对样品的缓冲体系没有要求;
(2)样品中蛋白量<10ug,尽量减少SDS等表面活性剂的使用,并注意降低盐浓度;
3、Co-IP样品
(1)如果您洗脱的样品需要跑胶,请按照1D SDS PAGE样品准备要求准备样品即可;
(2)推荐使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 缓冲体系进行蛋白洗脱;
4、样品运输
(1)推荐将样品冻干后进行运输。
(2)液体样品推荐干冰运输,短途运输冰袋也可以。
(3)在样品准备过程中需佩戴手套和头套,尽量避免自身蛋白对样品的污染。
中/英文项目报告
中英文双语版技术报告,内容包括
1、实验步骤
2、相关的质谱参数
3、质谱图片
4、原始数据
5、鉴定的蛋白质详细信息
一站式服务
下单寄送样品,一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告。
服务周期
自送样起******个工作日。